In der Steam-Version gab es als Vorbesteller-Bonus den "METAL GEAR SOLID: MASTER COLLECTION Vol.1 Pre-Order Bonus"
Dieser erweitert den Soundtrack um folgende Lieder:
・21 THE BEST IS YET TO COME (Master Collection ver.)
・22 CAN’T SAY GOODBYE TO YESTERDAY (Master Collection ver.)
・23 SNAKE EATER (Master Collection ver.)